Przetarg 12463096 - Wygenerowanie 20 polimorficznych loci mikrosatelitarnych...

owych dla:
ZADANIE 1
Opracowanie ww. loci mikrosatelitarnych (SSR) maślaka daglezjowego, Suillus lakei (Murrill) A.H. Sm. & Thiers na podstawie materiału biologicznego dostarczonego przez Zamawiającego. Próby do analiz będą stanowiły izolaty DNA otrzymane z owocników maślaka daglezjowego reprezentujących populacje różnego pochodzenia.
1) Zakres świadczonej usługi:
Optymalizacja procesu amplifikacji z wykorzystaniem zaprojektowanych starterów.
Amplifikacja loci SSR w próbkach dostarczonych przez Zamawiającego, z wykorzystaniem zaprojektowanych starterów. Łączna liczba prób dla badanego gatunku grzyba nie będzie przekraczała 100.
Sekwencjonowanie wysokoprzepustowe (HTS/NGS) uzyskanych ampliconów (na platformie Illumina lub równoważnej)
Analiza bioinformatyczna wyników sekwencjonowania.
Przekazanie Zamawiającemu surowych danych sekwencyjnych (FASTQ), oraz przetworzonych danych (genotypy w formacie tabelarycznym).
2) Materiał do analiz zostanie dostarczony jednorazowo, w terminie co najmniej 40 dni przed terminem realizacji zamówienia. Koszt dostawy ponosi Wykonawca.
3) Termin realizacji usługi: do 24.06.2026 r. Termin realizacji usługi Zamawiający rozumie jako termin przekazania wyników.
ZADANIE 2
Opracowanie ww. loci mikrosatelitarnych (SSR) złotoborowika wysmukłego, Aureoboletus projectellus (Murrill) Halling; na podstawie materiału biologicznego dostarczonego przez Zamawiającego. Próby do analiz będą stanowiły izolaty DNA otrzymane z owocników złotoborowika wysmukłego reprezentujących populacje różnego pochodzenia.
1) Zakres świadczonej usługi:
Optymalizacja procesu amplifikacji z wykorzystaniem zaprojektowanych starterów.
Amplifikacja loci SSR w próbkach dostarczonych przez Zamawiającego, z wykorzystaniem zaprojektowanych starterów. Łączna liczba prób dla badanego gatunku grzyba nie będzie przekraczała 100.
Sekwencjonowanie wysokoprzepustowe (HTS/NGS) uzyskanych ampliconów (na platformie Illumina lub równoważnej)
Analiza bioinformatyczna wyników sekwencjonowania.
Przekazanie Zamawiającemu surowych danych sekwencyjnych (FASTQ), oraz przetworzonych danych (genotypy w formacie tabelarycznym).
2) Materiał do analiz zostanie dostarczony jednorazowo, w terminie co najmniej 40 dni przed terminem realizacji zamówienia. Koszt dostawy ponosi Wykonawca.